交通部鐵道局長胡湘麟表示，南鐵地下化已展開地下隧道工程，鐵路地下化北起永康站南端之中華陸橋（永康橋）以南約0.17公里處，南至生產路以南約1.91公里，全長8.23公里，預定於2022年底完工，除將改建台南火車站為地下站，也將新增林森、南台南地下通勤車站，消除9處平交道、8處地下道、2處鐵路橋涵及3處陸橋，藉此縫合因鐵路劃分市區東西側都市空間結構並可保障地面及地下行車安全。
代理市長李孟諺表示，台南火車站為都市發展的重要樞紐，出入旅客之多占全國第4大站，古蹟站體已成為台南市重要「都市門戶意象」，火車站規劃對整體都市意象、都市機能與交通運輸等面向皆有重大影響。
規劃案維持舊台南火車站的古蹟地位，不因在鐵路地下化後被遺忘棄置，而是將原有車站與地下車站結合，通車後北門路西側，民眾一樣依以往搭乘習慣可由北門路下車後，通過原有車站前往地下車站搭車，前鋒路側則再新設車站出入口，規劃概念以舊站再生、新舊融和、新舊站出入口軸線一致等原則。
建築師張瑪龍表示，南部日照充足，大樹下綠蔭為民眾交流的場所，因此以鳳凰樹為意象，與古蹟車站優雅共構的新台南車站，將以下沉式廣場連結地面層及地下大廳，延續第1月台棚架元素，延續台南車站的歷史記憶，讓新舊站視覺穿透，亦提供民眾休憩及活動場所。
